نظام سیاسی اوگاندا جمهوری است و دارای پارلمان قانونگذاری است .

موسوینی فرمانده ارتش مقاومت ملی، که در 1986 قدرت را در دست گرفت، رئیس جمهور است. او نخست وزیر و دیگر وزیران را انتصاب می‌کند. شورای مقاومت ملی با 278 عضو نقش مشورتی دارد و متشکل است از 210 عضو که به طور غیر مستقیم انتخاب شده‌اند و 68 عضو منتصب از سوی رئیس جمهور است.